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液体活检关键技术研究

作者:Admin 发布时间:2021年04月15日16:40:09 580次浏览
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液体活检关键技术研究

行业领域:科学研究和技术服务业 —— 专业技术服务业

专利信息: 非专利技术

成熟度: 可以量产

技术合作方式: 合作生产

技术推广方式: 正在技术推广

技术交易价格: 面议

联系人:丘德翔

联系方式:13916313933

技术成果发布数:32

邮箱:397124@qq.com

成果内容简介

CTC细胞检测有两个关键的系统第一个最重要也是最核心的系统就是CTC细胞的鉴定系统 , 简单地说你是你用什么方法来鉴定癌细胞的。我们的CTC检测系统采用了临床能够广泛接受的癌细胞认定标准  并不追求覆盖完整的CTC细胞谱,但要求确实能够在待捡标本中完整的确认作为目标的某一类癌细胞。 关键技术FISH影像中靶基因杂交信号的自动标注的主要创新点在于:
1)红绿蓝三色通道图像的融合。尽管对同一位置切片重复拍照产生三色通道图像,但是图像之间仍会产生错位。现有的软件平台假设这样的错位为线形平移并运用图像配准技术计算错位量,从而实现三色通道图像的精准融合。切片的拍照和釆样是一个非线性的投影变换过程,因此线性估计在错位较大的样本中将产生较大误差。我们采用光流技术来估算中每个像素点在三色通道图像中的非线性错位,进而提高融合精度及成功率。该成熟技术已经成功应用于内窥镜的跟踪及卵巢癌的检测和分割。
2)细胞区域在蓝色通道图像中的分割。细胞的自动分割是FISH影像图像软件开发以及科研的重点。已有的软件如ISIS使用阈值方法以及用户的调整以实现最优的分割结果,阈值方法易受图像噪声的影响,而目前最新的科研成果却与软件开发相脱节。我们采用最新且极其稳定的科研算法以实现细胞的精确自动分割。
3)细胞区域中靶基因杂交信号数目的识别。已有的软件通过寻找红色和绿色通道图像中亮度最大值的点以检测靶基因杂交信号,但该类方法和阈值方法一样易受噪声的影响。本项目采用MSER方法来寻找靶基因杂交信号区域。MSER方法除了运用亮度值最大这一特征以外,还增加了该区域必须稳定且形状必须符合靶基因杂交信号一些额外的要求,从而减少检测误差。MSER是检测图像中亮度极值区域成熟且稳定的方法,我们也使用该方法设计了CT图像中精确发现肾结石的计算机算法,因此将该方法应用于分子影像是软件设计的一大创新。通过细胞图像的自动分割和靶基因杂交信号数目的识别,我们可以产生当前病人的单位细胞中靶基因杂交信号数目的统计报告和分析。
4)融合通道图像的局部增强及平滑去噪。目前已有的软件如Bioview和ISIS只是允许用户改变图像显示的windows-level值来调整图像的局部增强和平滑去噪,但是该类方法非常取决于图像的采集质量和用户的使用经验。我们采用偏微分方程中热力学传导方法在图像中的应用,以数学的方法自动稳定的实现局部增强和平滑去噪。假设当前图像是一个热力场,其中每一个像素值代表温度,图像的局部增强和平滑去噪则可视为一个温度传导过程。其中平滑去噪表现为线性弥散过程,即像素值最终在图像中趋于近似以达到平滑的效果。而局部增强则为非线性弥散过程,即像素值在需要增强的图像区域保持不变或增加,而在其他区域则进行平滑。    

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